Ibu kota Maluku adalah Ambon yang bergelar atau memiliki julukan sebagai Ambon Manise, kota Ambon berdiri di bagian selatan dari Pulau Ambon yaitu di jazirah Leitimur.
Berbatasan langsung dengan Maluku Utara dan Papua Barat di sebelah utara, Laut Maluku, Sulawesi Tengah, dan Sulawesi Tenggara di sebelah barat, Laut Banda, Timor Leste, dan Nusa Tenggara Timur di sebelah selatan serta Laut Aru dan Papua di sebelah timur.
Berikut adalah daftar 9 kabupaten dan 2 kota di provinsi Maluku per 2018
| Kabupaten /Kota | Pusat Pemerintahan | Jumlah Kecamatan | Kelurahan /Desa |
|---|---|---|---|
| Kabupaten Buru | Namlea | 10 | -/82 |
| Kabupaten Buru Selatan | Namrole | 6 | -/79 |
| Kabupaten Kepulauan Aru | Dobo | 10 | 2/117 |
| Kabupaten Maluku Barat Daya | Tiakur | 17 | 1/117 |
| Kabupaten Maluku Tengah | Masohi | 18 | 6/186 |
| Kabupaten Maluku Tenggara | Langgur | 11 | 1/190 |
| Kabupaten Maluku Tenggara Barat | Saumlaki | 10 | 2/80 |
| Kabupaten Seram Bagian Barat | Piru | 11 | -/92 |
| Kabupaten Seram Bagian Timur | Bula | 15 | -/198 |
| Kota Ambon | - | 5 | 20/30 |
| Kota Tual | - | 5 | 3/27 |
*Kementerian Dalam Negeri Republik Indonesia
