Ibu kota Maluku Utara adalah Sofifi. Maluku Utara resmi terbentuk pada tanggal 4 Oktober 1999, melalui UU RI Nomor 46 Tahun 1999 dan UU RI Nomor 6 Tahun 2003.
Sebelum resmi menjadi sebuah provinsi, Maluku Utara merupakan bagian dari Provinsi Maluku, yaitu Kabupaten Maluku Utara dan Kabupaten Halmahera Tengah.
Provinsi Maluku Utara terdiri dari 1.474 pulau, jumlah pulau yang dihuni sebanyak 89 dan sisanya sebanyak 1.385 tidak berpenghuni.
Berikut adalah daftar 8 kabupaten dan 2 kota di provinsi Maluku Utara per 2018
| Kabupaten /Kota | Pusat Pemerintahan | Jumlah Kecamatan | Kelurahan /Desa |
|---|---|---|---|
| Kabupaten Halmahera Barat | Jailolo | 8 | -/169 |
| Kabupaten Halmahera Tengah | Weda | 10 | -/61 |
| Kabupaten Halmahera Timur | Maba | 10 | -/102 |
| Kabupaten Halmahera Selatan | Labuha | 30 | -/249 |
| Kabupaten Halmahera Utara | Tobelo | 17 | -/196 |
| Kabupaten Kepulauan Sula | Sanana | 12 | -/78 |
| Kabupaten Pulau Morotai | Daruba | 5 | -/88 |
| Kabupaten Pulau Taliabu | Bobong | 8 | -/71 |
| Kota Ternate | - | 7 | 77/- |
| Kota Tidore Kepulauan | - | 8 | 40/49 |
*Kementerian Dalam Negeri Republik Indonesia
